引言:作为全球血液学领域最大最权威的国际学术盛会之一,第62届美国血液学会年会(ASH)吸引了来自全球多个国家的近三万名血液学专家、学者和其他专业人士参会,会议期间有数千份报告的精彩呈现。来自美国埃默里医学院,Aflac癌症和血液疾病中心的BeenaEThomas教授在本次ASH会议上报道了他们最新的研究:单细胞转录组学揭示了与小儿急性髓系白血病复发和缓解相关的急性髓系白血病和非急性髓系白血病细胞群。
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Introduction
虽然一线常规化疗的进展增加了儿童AML获得缓解的可能性,但复发率仍然很高(25-35%),需要新型疗法(Zhang,Savage等,)。AML的临床和分子异质性使其研究变得复杂,并为新型疗法的开发带来了挑战(Bolouri,Farrar等人,)。识别复发的基础细胞和途径对于促进新型疗法的开发非常重要。单细胞RNA测序(scRNA-Seq)允许深入分析异质性AML的全貌,以提供肿瘤微环境的详细视图,揭示可能与复发或完全缓解相关的原始细胞和免疫细胞的群体。
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MethodandResults
该团队分析了我们机构生物库中14个儿科AML骨髓样本中的36,个细胞,跨越不同的AML亚型和3个健康儿童,以生成一个全面的scRNA-Seq图谱,其中包括未成熟的AML相关原始细胞和微环境细胞。使用基于液滴的条形码技术(Panigrahy,Gartung等人,),在诊断时(Dx)、诱导期结束(EOI)和复发时(Rel)收集的样本用于生成scRNA-Seq数据。在对scRNA-Seq数据进行归一化处理后,使用主成分分析和统一流形逼近和投影(UMAP)技术识别细胞簇(Becht等,)。复发和缓解患者之间的差异表达、途径和系统生物学分析揭示了特定细胞簇的差异(Panigrahy,Gartung等,)。为了确定我们的AMLblast细胞特异性标志物的临床结果之间的联系,使用cox比例风险生存模型对AMLTARGET数据(