白癜风怎么能治好了 http://baidianfeng.39.net/bdfby/yqyy/年2月，赵维莅教授在《FRONTIERSINONCOLOGY》杂志在线发表题名为“Single-CellTranscriptomeAnalysisIdentifiesLigand–ReceptorPairsAssociatedWithBCP-ALLPrognosis.”——单细胞转录组分析鉴定与BCP-ALL预后有关的配体-受体对的研究论文。
血液学科赵维莅主任医师、*金艳研究员为论文共同通讯作者，吴亮硕士研究生、姜明昊硕士研究生为论文共同第一作者。
doi:10./fonc...
急性B淋巴前体细胞白血病（BCP-ALL）是由于B淋巴前体细胞在骨髓中的异常增殖而引发的一类血液系统恶性肿瘤，目前仍然是儿童癌症的主要死亡因素之一。化疗、靶向治疗等手段对大多数初发的BCP-ALL病人有效果，但其中相当一部分患者会在五年内复发，对药物耐受并最终导致死亡。造成这一状况的主要原因是BCP-ALL具有高度的异质性以及免疫微环境的广泛重塑。细胞的组成及细胞与细胞间的交流通讯共同构成了BCP-ALL特异的免疫微环境。骨髓内的细胞通讯深刻影响着肿瘤的发生、进展以及侵袭等过程。更好的了解骨髓内部的细胞与细胞间的相互作用，对于理解白血病的发病原因以及临床上相关药物和治疗方法的开发，都具有十分重要的作用。
在本研究中，课题组基于7例BCP-ALL和4例健康人的公共scRNA-seq数据，系统性描述了BCP-ALL的骨髓细胞图谱后，从2个方面对BCP-ALL骨髓微环境中的细胞通讯情况进行了探索。一是肿瘤相关的B细胞内部的通讯网络，鉴定出24对上调以及33对下调的配体-受体对。二是髓系细胞与B细胞的通讯网络，分别鉴定出11对髓系细胞向B细胞通讯的配体-受体对以及18对髓系细胞向B细胞通讯的配体-受体对。在这些众多的配体、受体基因中，相当一部分已经有研究证明其在肿瘤生成和进展中发挥了不同的作用。
为了更好地利用课题组发现的这些配体-受体对来预测BCP-ALL病人的预后，基于这些配体、受体基因的表达水平，通过LASSO回归构建了一个机器学习预后预测模型。基于最终保留的11个基因，构建了LR(ligand–receptor)分数。在用于训练预后模型的TARGET队列中，高分数组的病人的预后要明显差于低分数组，这种区分在我们的验证队列中也同样存在。
在进一步的扩大化分析中，基于TCGA数据库的36类肿瘤病人表达谱数据，课题组发现LR分数能够显著区分相当一部分类型的肿瘤病人预后，其中以AML效果最好，这进一步说明了LR分数对于血液肿瘤预后的良好预测效能。
通过配体-受体对的鉴定，发现了一些在BCP-ALL骨髓微环境中发挥重要作用的基因，希望这些发现有助于进一步解释BCP-ALL的疾病机理。而基于配体、受体基因构建的LR分数，可以为BCP-ALL患者的临床诊断规范提供一定的帮助。
Bcellprecursoracutelymphoblasticleukemia(BCP-ALL)isabloodcancerthatoriginatesfromtheabnormalproliferationofB-lymphoidprogenitors.Cellpopulation
